Misi Sekolah SD Muhammadiyah Wirobrajan I adalah Melaksanakan Pembelajaran aktif, kreatif, dan inovatif dengan prinsip enjoy to learning, dengan langkah – langkah :

1. 1. Melaksanakan ajaran Islam sesuai Al-Qur’an dan As Sunnah
   2. Membentuk generasi yang berbudaya Islami
   3. Melaksanakan pembelajaran PAIKEM dengan model lesson study
   4. Membentuk generasi yang berprestasi di bidang olahraga
   5. Membentuk generasi yang terampil di bidang seni
   6. Membiasakan perilaku hidup bersih dan sehat
   7. Membiasakan perilaku 5S (Senyum Salam Sapa Sopan dan Santun)
   8. Membiasakan perilaku berbudaya sesuai paham Muhammadiyah.
   9. Melaksanakan Pendidikan lingkungan hidup

Tujuan Sekolah

Tujuan pendidikan dasar secara umum adalah meletakkan dasar kecerdasan, pengetahuan, kepribadian, akhlak mulia, serta keterampilan untuk hidup mandiri dan mengikuti pendidikan selanjutnya.

Secara khusus tujuan pendidikan di SD Muhammadiyah Wirobrajan I Yogyakarta adalah:

1. Siswa dapat melaksanakan ajaran agama Islam sebagai hasil  proses pembelajaran dan kegiatan pembiasaan

2. Siswa dapat meraih prestasi akademik maupun non akademik minimal tingkat Kota Yogyakarta;

3. Menguasai dasar-dasar ilmu pengetahuan dan teknologi sebagai bekal untuk melanjutkan ke sekolah jenjang selanjutnya;

4. Menjadi sekolah pelopor dan penggerak di lingkungan masyarakat sekitar;

5. Menjadi sekolah yang diminati  masyarakat.

6. Mencetak generasi cinta lingkungan